La tecnología BeCrop®

¿Qué es BeCrop®? y preguntas frecuentes

La tecnología BeCrop® proporciona información clave para mejorar la salud del suelo, aumentar el rendimiento y la calidad de los cultivos y reducir los costes agrícolas. Por esto, BeCrop® es la pieza que faltaba en el rompecabezas de la agricultura, ya que conecta las necesidades del suelo con los insumos e indica el camino hacia la regeneración de los suelos.

¿Podemos distinguir el ADN vivo del muerto? 

¿Hemos observado las diferencias entre los mismos informes realizados con y sin células muertas/vivas diferentes?

Hemos validado en nuestro laboratorio un protocolo que utiliza monoazida de propidio (PMA) para capturar ADN extracelular, que podemos realizar previamente al paso de aislamiento del ADN. La anotación taxonómica de especies en baja abundancia relativa es la más variable. La anotación funcional, así como las interacciones ecológicas entre taxones que también están presentes en el informe BeCrop®, se ven menos afectadas por la extracción de ADN extracelular.

Sin embargo, para aplicaciones de descubrimiento y diagnóstico de biomarcadores, tenemos la filosofía de que todas las señales presentes en el suelo, de microorganismos vivos y muertos, son relevantes. Por ello, nuestros informes BeCrop® se basan en la extracción y amplificación del ADN total. A continuación, las muestras se comparan con otras muestras derivadas del mismo cultivo para normalizar cada uno de los marcadores en quintiles. Así pues, no recomendamos extraer el ADN extracelular de las muestras BeCrop®, dado que la interpretación se realiza en el contexto de otras muestras para las que hemos realizado la extracción total de ADN.

Para proyectos de I+D autónomos en los que las muestras se comparan entre sí, sin duda podemos aplicar el protocolo PMA. Además, para nuestro informe BeCrop® Product (cuantificación bacteriana absoluta de Ag-inputs) algunos de nuestros clientes solicitan la eliminación del ADN extracelular para evaluar la viabilidad de sus productos, así como su vida útil.

¿Cuál es vuestra especialidad?

Con esta información, creamos una evaluación funcional del suelo basada en las relaciones de la comunidad microbiana para cada lugar y cultivo específicos.

¿Cuáles son las diferencias entre un análisis fisicoquímico y un análisis funcional BeCrop®?

Los análisis de suelo tradicionales proporcionan información sobre las propiedades físicas (por ejemplo, la textura) y químicas del suelo, como el pH o la concentración de nutrientes, pero no tienen en cuenta la microbiología del suelo. En lugar de medir el número de nutrientes presentes en el suelo, BeCrop® mide los procesos microbianos que intervienen en el ciclo de los nutrientes, como los que fijan carbono en el suelo o suministran a las plantas formas de nutrientes disponibles (por ejemplo, mineralización o solubilización) y los que inmovilizan los nutrientes de nuevo en formas no fácilmente disponibles para las plantas (inmovilización, desnitrificación).

Tecnología BeCrop® Perfiles microbianos frente al análisis shotgun

Cada método tiene sus pros y sus contras, que deben tenerse en cuenta antes de decidir qué método de secuenciación utilizar. Si necesita∫ una explicación sencilla de cada tipo de análisis véase Secuenciación del gen del ARNr 16S frente a secuenciación metagenómica Shotgun. 

¿Mide BeCrop® el % de materia orgánica o el número de nutrientes (N, P, K, etc.) del suelo?

Tales como los que suministran a las plantas formas de nutrientes disponibles (por ejemplo, mineralización o solubilización), y los que inmovilizan los nutrientes de nuevo en formas no fácilmente disponibles para las plantas (inmovilización). 

 ¿Es BeCrop un análisis cuantitativo o cualitativo?

El análisis de BeCrop® es cuantitativo, y se transforma posteriormente en un informe cualitativo. El cuantitativo varía en relación con el número de muestras.

¿Puedo comparar los resultados de dos análisis diferentes de BeCrop®?

Sí, eso puede lograrse con la utilización del análisis multivariable.